Page 31 - Hekim Sözü - Sayı 11 - Eylül-Ekim 2020
P. 31

DOSYA


                                                                               biri olarak karşımıza çıkmaktadır.
                                                                               Sahip olduğumuz biyolojik özelliklerin
                                                                               milyonlarca yıllık bir evrimsel sürecin
                                                                               sonunda oluştuğu düşünülürse virüsle-
                                                                               rin hem geçmişte hem de günümüzde
                                                                               insan evrimindeki önemi ortaya çıkar.
                                                                               Şimdi bu etkilere biraz daha yakından
                                                                               bakalım.
                                                                               Retrotranspozonların insan genomuna
                                                                               etkisi büyük oranda aşırı miktardaki
                                                                               kopya sayısından kaynaklanır. Öyle ki
                                                                               ortalama olarak her 3000 bazda bir bir
                                                                               retrotranspozon olan Alu tekrar dizisi
                                                                               vardır. Bu dizilerin retrotranspozis-
                                                                               yonunun insanda her yirmi doğumda
                                                                               bir bir araya girme olarak tahmin
                                                                               edilmektedir (Cordaux, R ve diğ. 2006)
                                                                               Protein şifreleyen bölgeye transpoze
                                                                               olup bu şekilde araya girerek yapı
                                                                               bozumuyla ilişkilendirilen 65 durum
                                                                               tanımlanmıştır ve bunların hemo-
                                                                               fili, kistik fibroz, Apert sendromu,
                                                                               Duchenne müsküler distrofi, hiperko-
                                                                               lesterolemi ve meme  ve kolon kanseri
                                                                               gibi kalıtsal hastalıklara neden olduğu
                                                                               bildirilmiştir (Callinan ve Batzer, 2006)
                                                                               Bir retrovirüs genoma yerleştiğinde ve
            almaktadır ve bunlar, etkinlikleri de-  gelir (Dewannieux M ve Heidmann T,   genomun başka bölgelerine kendini
            ğişken ölçekte olsa da, genomumuzun   2013). Milyonlarca yıllık süreçte omur-  kopyaladığında gittiği yer yukarıda be-
            yaklaşık % 45 kadarını oluşturmaktadır   galıların genomunda binlerce viral ge-  lirtildiği gibi genin kendisi ya da gen
            (Buzdin A, 2007). İnsan endojen retor-  nom kalıntısı birikmiştir. Fakat bunlar   düzenleyici bölgenin yakını olabilir.
            virüslerinin tüm genomun salt %8’ini   yerleşik element olarak kalmaz, klasik   Bu elbette söz konusu viral parçanın
            oluşturduğu ve bunun tüm genomda   durumdaki hücreleri istila edip onun   gittiği yerdeki genin çalışmasına etki
            protein şifreleyen kısmın yaklaşık 4   mekanizmaları aracılığıyla kendini   etme potansiyeli anlamına gelir. Genin
            katı kadar bir yer tuttuğu göz önünde   çoğaltmaktan çok farklı olarak tek bir   içine girerek yapısını bozabilir ya da
            bulundurulursa bu yapıların önemi   hücrenin genomunda, RNA halinde   o genin çalışma düzenini değiştirebi-
            daha iyi anlaşılabilir. Retrovirüsler   kopyalarını çıkarıp genomun başka bir   lir. Bu yukarıda örneklenen olumsuz
            tipik olarak vücut dokularını enfekte   bölgesine DNA parçası olarak yerleşe-  bir sonuca yol açabileceği gibi yeni
            eder fakat enfekte ettiği konağın po-  bilir. Bu tablo bize bu viral parçaların   işlevlerin ya da çalışma kombinasyon-
                                                                               larının ortaya çıkması anlamına da
            pülasyonunda yayıldıkça, daha düşük   salt pasif kalıntılar olmadığını, insan
            bir olasılıkla olmakla beraber, üreme   genomunun dizilimini değiştirebilme   gelebilir. Genel olarak bakıldığında
            hücrelerini de enfekte eder ve onların   yetisine sahip olduklarını ve bunun   retrovirüslerin sahip oldukları birbirini
                                                                               tekrar eden uç kısımları bir genin ça-
            genomlarına yerleşir. Konak popülas-  sonucunda genomun çalışma biçimini   lışmaya başlamasını sağlayan başlatıcı
            yonuna bu şekilde giren virüsler artık   etkileme potansiyeli taşıyan molekül-  bölge (promötör) işlevini görebilir,
            genetik bir bileşen olarak endojen ret-  ler olduğunu göstermektedir. Bu, viral   genin anlatımını artıran (enhancer) ya
            rovirüs adını alır ve bu aşamadan son-  kalıntıların, genomun hem normal   da baskılayan bir etkide bulunabilir,
            ra doğal seçilim ve genetik sürüklenme   işlerliğinde yaratacağı avantaj ya da   kromatinin bükülmesini sağlayabilir
            gibi evrimsel etkenlerin karmaşık   dezavantajlara hem de bir virüsün yol   ve pek çok düzenleyici protein için
            etkileşimleri sonucunda konak genom-  açacağı bulaşıcı hastalıklardan farklı   bağlanma bölgesi oluşturabilir. (Young
            larında sabitlenebilir ya da ortadan   olarak başka hastalıkların altında   J. ve diğ, 2013) İnsan genomunda
            kalkabilirler. Fakat genoma yerleşip   yatan mekanizmaları da oluşturabile-  gen işlevinin başlamasında etkili
            sabitlenen virüsler olduğu haliyle tam   ceğine işaret etmektedir. Bu nedenle   olan proteinlerin DNA’ya bağlanma
            bir virüs olarak kalmaz, binlerce yıl   öyle görünüyor ki bugün bir tür olarak   bölgelerinin %20-30 viral ya da virüs
            boyunca üzerlerinde çeşitli mutasyon-  sergilediğimiz biyolojik, genetik ve   benzeri kalıntılar olduğu gösterilmiştir
            lar biriktirmeleri nedeniyle klasik viral   davranışsal özelliklerin yanı sıra sahip   (Garazha A. ve diğ, 2015)  Öte yandan
            çoğalma mekanizmalarını yitirerek   olduğumuz hastalıklar bağlamında   insandaki endojen retrovirüslerin
            daha pasif bir genetik kalıntı haline   da virüsler bizi biz eden etkenlerden   yaklaşık %50’si dokularda gen anla-


                                                                                     EYLÜL-EKİM 2020  hekim sözü  29
   26   27   28   29   30   31   32   33   34   35   36